В будущем машины вышли из повиновения, и если людям не удастся выиграть схватку с созданным ими самими искусственным интеллектом, человечество погибнет. У людей еще есть шансы, но возглавляющий сопротивление Джон Коннор для роботов — как бельмо на глазу, и они отправляют в прошлое терминатора нового поколения. Т-1000 с корпусом из жидкого металла, напичканный электроникой, практически неуязвимый, перемещается в Лос-Анджелес 1994 года, чтобы уничтожить мальчишку Джона Коннора — не дать ему вырасти, выучиться на программиста и стать тем, кем он стал в будущем, то есть, главной опасностью для взбунтовавшихся машин. Конечно, тот Джон Коннор — гениальный стратег и программист из будущего — узнаёт о планах роботов и одновременно с Т-1000 отправляет в своё детство хорошо знакомого зрителю терминатора модели Т-800 с противоположной задачей: любой ценой защитить ребенка по имени Джон Коннор. Былой враг несколько раз помогает мальчику уйти от преследования Т-1000, рассказывает правду, в которую до последнего не верит до смерти напуганная появлением монстра Сара. Но и она уступает: у матери и сына нет другого выхода — только довериться Т-800. Судный день наступит, когда два монстра, порожденные человеческим разумом, сойдутся в смертельной схватке.

Томас Андерсон принадлежит к обычному "офисному планктону", который недолюбливает начальство. Получая очередную порцию претензий и недовольства от босса, герой возвращается домой и становится самим собой. Оказывается, Томас - первоклассный хакер, работающий под ником Нео. В Сети нет ни одного места, куда бы он не смог пробраться. Несмотря на прошлую судимость, герой продолжает подрабатывать продажей различных вирусов и незначительной для него информации. Но наступает день, когда Нео невольно узнаёт страшную правду, с которой он долгое время не мог смириться. Всё, что когда-то окружало его, на самом деле является иллюзией, прописанной как код внутри человеческого мозга. Матрица - цифровая копия мира, подключенная к разуму человека. Как оказалось, настоящий мир давным-давно разрушен, не осталось ничего, кроме руин и вечной ночи. Всё поработили машины, а люди являются для них всего лишь батарейками, с помощью которых роботы и выживают. Освободиться из Матрицы Томасу помогли люди из настоящего мира - повстанцы, выживающие на просторах руин. Почему же выбрали именно его? На этот вопрос ему отвечает Морфеус - один из главных советчиков Сената и капитан корабля. Морфеус уверен в том, что Нео - избранный, способный избавить человечество от власти машин и возродить прежнее величие людей.

Фильм расскажет о создании искусственного интеллекта и последствиях этого прорыва в области технологий. Известного исследователя Уилла Кастера, всегда мечтавшего создать умные машины, ожидает скорая смерть из-за отравления полонием. Он предпринимает последнюю попытку осуществить свой замысел и решается на довольно рискованный эксперимент. При помощи своей жены Эвелин и своего друга Макса Вотерса он копирует и переносит свое сознание в компьютер. Все проходит удачно, и после своей физической смерти Уилл остается существовать в Сети. Постепенно всем становится понятно, что Уилл стремится к мировому господству. Он создает собственную лабораторию по нано разработкам и постепенно подчиняет себе людей, внедряя в них наночастицы под предлогом лечения ран. Вскоре и Эвелин начинает видеть в действиях мужа угрозу всему миру. Она присоединяется к Максу, их коллегам и RIFT, и с помощью Эвелин им удается внедрить в Уилла вирус. Вместе с Уиллом отключается вся Сеть. Люди оказываются в мире без технологий и пытаются восстановить прежнюю жизнь.